台灣有安溪移民的部落都建有祖師廟。民間傳說中的清水祖師有多種稱號： 「麻章上人」、「昭應大師」、「烏面祖師」、「藥師祖師」、「蓬萊祖師」 「昭應祖師」、「輝應祖師」、「落鼻祖師」、「祖師公」或「祖師爺」等。 民間傳說祂是北宋福建泉州安溪的高僧，由於祂在「安溪蓬萊山清水巖」修道 被尊稱為「清水祖師」。

 

歷史上清水祖師確有其人:清水祖師的俗家姓陳，但祂的名字有多種說法，如 「普足」、「昭應」、「榮祖」等。 根據朱熹(1198年)的<<桃源南山陳氏族譜>>記載: 「普足」是清水祖師出家 後的法號，「榮祖」是清水祖師出家前的名字。

 

清水祖師生於宋仁宗景祐四年（１０３７年），升遐於宋徽宗建中靖國元年（１１０１年），世壽六十五歲。由於祂為民眾祈雨、治病、除 妖降魔、修橋造路芝靈驗事蹟甚多，朝廷累風廣惠、慈濟、善和大師。民間立廟供奉，崇拜範圍已超出泉州府，而尤以安溪人移民來台之聚 落最為普及。

 

根據永春縣志的記載，宋神宗元豐元年(1078年)安溪大旱災，清水祖師應當地友人劉公銳邀請到安溪祈雨，頓時雨勢豐沛，旱象全消，於是 被當地百姓極力挽留而落腳於清溪(今福建安溪縣)「清水巖」。由於許多安溪人以種茶為業，風調雨順極關茶葉生產質量，清水祖師祈雨成 功後，被奉為安溪鐵觀音茶的保護神。

安溪人從大陸渡海到北台灣最早是在淡水、艋舺建立基業，而後部分先民再溯新店溪而上，到景美溪仔口靠岸。上岸後，一面墾荒建屋，一面在河岸邊興建供奉故鄉「清水祖師」的廟宇，即是「萬慶巖清水祖師廟」。本廟建於道光十一年(西元1831年)，是景美地區最古老的廟宇，迄今(2015年)已有一百八十四年的歷史。景美溪口當年為台北往新店、木柵、深坑、石碇等地水陸必經之渡船頭。一時舟楫輻輳，絡繹不絕，而江水如藍，江花勝火，市聲喧聒，展現一片美麗繁華的景像。往來客商於渡船前後常先朝香膜拜，故本廟當年香火之盛可想而知本廟建廟之初應有高人指點，廟門中軸線直對新店筆架山之右山尖，取其文筆聳拔，文運昌隆，考試無往不利。再者，景美溪溯流朝本廟，所謂「逆水一杓值千金」，可收納旺氣、聚財寶之效；本廟左龕奉文昌帝君以保佑學子金榜題名,右龕奉武財神關聖帝君保佑信眾忠義立業、財源廣進。

 

配合地理形勝，相得益彰，應非偶然。

三尊開廟清水祖師神像是本廟鎮廟之寶。2011年5月30日重新以安全玻璃保護，更顯莊嚴神聖。另『門開甘露』匾額及『萬慶巖』古石香爐亦為本廟重要古文物，可為本廟之年代久遠作見證。

本廟為往日新店溪及景美溪水陸交通樞紐之移民信仰中心，也是文山地區持續繁榮發展之守護神。現更廣受全台各地廣大信眾之尊崇，經常結隊組團前來參拜，已成為全台重要祖師廟，也是北台灣開發史上的重要里程碑及彌足珍貴的史蹟。